هرآنچه باید در مورد ژن بدانید
ژن واحد بنیادی وراثت در موجودات زنده محسوب میشود که به عنوان قطعهای از DNA تعریف میشود و پروتئینها یا مولکولهای RNA عملکردی را کدگذاری میکند. درک مدرن از ژنها گسترش یافته است تا نه تنها توالیهای کدگذاری DNA بلکه عناصر تنظیمی که بر بیان آنها تأثیر میگذارند را نیز شامل شود.
این تعریف دقیق، پیچیدگی عملکرد ژن در فرآیندهای زیستی را نشان میدهد و اهمیت ژنها را در وراثت خصوصیات، عملکردهای سلولی و توسعه کلی موجودات زنده مشخص میکند. به طور تاریخی، مفهوم ژن تحت تأثیر نظریههای علمی مختلفی شکل گرفته است که از مدلهای اولیهای مانند فرضیه یک ژن-یک آنزیم که توسط بیادل و تاتوم پیشنهاد شده بود، شروع شده و بعدها به مفهوم یک ژن-یک پلیپپتید توسط یانفسکی اصلاح شده است.

این ایدهها به طور چشمگیری به درک فعلی ما از نحوه کدگذاری ژنها برای پروتئینهایی که نقشهای حیاتی سلولی را ایفا میکنند، کمک کردهاند. در این مطلب قصد داریم در مورد ژنها، ساختار و نحوهی عملکرد آنها و چگونگی وراثت و تاثیر آنها بر عملکرد کلی بدن جانداران بحث کنیم.
تعریف ژن
اصطلاح ((ژن)) از کلمه یونانی ((genetikos)) مشتق شده است که بر نقش اصلی آن را در وراثت ژنتیکی و منشأ زیستی تأکید میکند. تعریف اصطلاح ژن ابتدا برای معرفی یک واحد انتزاعی وراثت بدون ویژگیهای مادی خاص به آن ابداع شد. با گذشت زمان، به ویژه با پیشرفتهای علوم ژنتیک و زیستشناسی مولکولی، تعریف ژن به طور قابل توجهی تکامل یافته است.
مفهوم ژن تحت تأثیر فرضیات مختلفی در طول تاریخ ژنتیک قرار گرفته است. مدلهای اولیه پیشنهادی از سوی بیادل و تاتوم رابطه یک ژن-یک آنزیم را پیشنهاد کردند که بعداً به فرضیه یک ژن-یک پلیپپتید که توسط یانفسکی تدوین شده است، تکامل یافت. این پیشرفت، درک این نکته را به تصویر میکشد که یک ژن به عنوان واحد اساسی اطلاعات ژنتیکی، مسئول کدگذاری پلیپپتیدهایی است که برای عملکردهای سلولی ضروری هستند.

به طور کلی، اکنون ژنها به عنوان اجزای ضروری ژنوم شناخته میشوند که نقشهای متمایز در انتقال و بیان اطلاعات وراثتی دارند. یک تعریف مدرن نه تنها شامل نواحی کدگذاری DNA میشود که سنتز پلیپپتیدها را هدایت میکند بلکه همچنین عناصر تنظیمی و سایر اجزاء عملکردی که برای بیان ژن ضروری هستند را شامل میشود.
تعداد ژنها در موجودات زنده
تعداد ژنها در ژنوم یک موجود زنده (کل مجموعه کروموزومها) بین گونهها به طور قابل توجهی متفاوت است. به عنوان مثال، در حالی که تخمین زده میشود که ژنوم انسان حاوی 20000 تا 25000 ژن است، ژنوم باکتری اشریشیا کلای (Escherichia coli O157:H7) دقیقاً حاوی 5416 ژن است. آرابیدوپسیس تالیانا (Arabidopsis thaliana) اولین گیاهی که یک توالی ژنومی کامل برای آن بازیابی شد، تقریباً 25500 ژن دارد. ژنوم آن یکی از کوچکترین ژنومهای شناخته شده برای گیاهان است. در میان ارگانیسمهای موجود که به طور مستقل تکثیر می شوند، باکتری مایکوپلاسما ژنیتالیوم (Mycoplasma genitalium) با 517 ژن، کمترین تعداد ژن را بین موجودات زنده دارد.

انواع ژنها
ژنها به طور کلی به چند نوع مختلف طبقهبندی میشوند که هر کدام وظایف و ویژگیهای خاص خود را دارند. در ادامه به انواع مهم ژنها اشاره میشود:
1. ژنهای کد کننده (Coding Genes)
این ژنها حاوی اطلاعات لازم برای تولید پروتئینها هستند و به طور عمده اگزونها (Exons) را در بر میگیرند. اگزونها در فرآیند رونویسی به mRNA تبدیل شده و در نهایت به پروتئینها ترجمه میشوند.
2. ژنهای غیرکد کننده (Non-coding Genes)
این دسته از ژنها کد ساخت پروتئینها را ندارند، اما نقشهای دیگری در سلول دارند. انواع مختلفی از ژنهای غیرکد کننده شامل موارد زیر است:
- ژنهای RNA کوچک: مانند tRNA و rRNA که در فرآیند ترجمه و ساخت پروتئینها نقش دارند.
- ژنهای تنظیمی: این ژنها در تنظیم بیان ژنهای دیگر دخالت دارند و شامل RNAهای غیرکد کننده (ncRNA) میشوند که میتوانند با mRNAها یا پروتئینها تعامل کنند.

2.ژنهای جهشی (Mutant Genes)
این ژنها به دلیل جهشهای ژنتیکی به وجود میآیند و ممکن است باعث ایجاد صفات جدید یا بیماریها در موجود زنده شوند. جهشها میتوانند به صورت نقطهای، حذف یا اضافه شدن نوکلئوتیدها باشند.
4. ژنهای غیرفعال (Pseudogenes)
این گروه از ژنها، آنهایی هستند که در گذشته عملکرد داشتند، اما به دلیل جهشها یا تغییرات دیگر، توانایی کدگذاری پروتئینها را از دست دادهاند. برخی از آنها ممکن است به طور غیرمستقیم بر بیان ژنهای دیگر تأثیر بگذارند.

5. ژنهای تنظیم کننده (Regulatory Genes)
این ژنها مسئول تنظیم بیان سایر ژنها هستند و میتوانند در سطح رونویسی یا ترجمه عمل کنند. ژنهای تنظیمی، میتوانند پروتئینهای تنظیمکنندهای تولید کنند که به تنظیم پروموترها و سایر عناصر تنظیمی بپردازند.
6. ژنهای پایدار (Conserved Genes)
این ژنها در طول تکامل موجودات زنده در تعدادی از گونهها حفظ شدهاند و معمولاً نقشهای اساسی در بقا و عملکرد سلول دارند.
7. ژنهای ویروسی
این گروه مربوط به ویروسها هستند و میتوانند به مقایسه و شناسایی انواع مختلف ویروسها کمک کنند. آنها به صورت RNA یا DNA یافت میشوند.
ساختار ژنها
ژنها قطعاتی از DNA هستند که پروتئینها را کدگذاری میکنند و واحدهای بنیادی وراثت را تشکیل میدهند. ژنها از دی اکسی ریبونوکلئیک اسید (DNA) تشکیل شدهاند (به جز در برخی از ویروسها که دارای ژنهای متشکل از یک ترکیب نزدیک به DNA به نام اسید ریبونوکلئیک (RNA) هستند). برای شناخت ساختار مولکولی ژنها ابتدا باید به بررسی ساختمان DNA بپردازیم.
ساختمان DNA
هر مولکول DNA از دو زنجیره بلند تشکیل شده است که به شکل دو مارپیچ در هم تنیده به نظر میرسد و شبیه یک نردبان است که از میلیونها پله تشکیل شده است. این پلهها از جفتهای چهار نوع نوکلئوتید تشکیل شدهاند: آدنین (A)، تیمین (T)، گوانین (G) و سیتوزین (C). در ساختمان DNA، نوکلئوتید A همیشه با T و G همیشه با C پیوند میخورد. مولکولهای طویل DNA به شدت متراکم و پیچ خورده هستند و به این شکل درون کروموزومها سازماندهی شدهاند.

اگر پیوندهای بین بازهای هر نوکلئوتید شکسته شود، دو زنجیره باز میشوند و نوکلئوتیدهای آزاد درون سلول، خود را به بازهای در معرض زنجیرههای جدا شده میچسبانند. نوکلئوتیدهای آزاد در امتداد هر زنجیره طبق قانون جفت شدن باز قرار میگیرند، A به T و C به G پیوند میخورد. این فرآیند منجر به ایجاد دو مولکول DNA یکسان از یک الگوی اصلی میشود و روشی است که توسط آن اطلاعات ارثی از یک نسل از سلولها به نسل بعدی منتقل میشود.
کد ژنتیکی
کد ژنتیکی مجموعهای از قوانین است که نحوه تطابق توالیهای نوکلئوتیدها در DNA و RNA با توالیهای آمینو اسیدها در پروتئینها را تعیین میکند. این کد شامل کدونهای سهگانهای است که هر یک آمینو اسیدهای خاصی را مشخص میکنند یا آغاز و پایان سنتز پروتئین را علامتگذاری میکنند. این کد تقریباً در تمام موجودات زنده یکسان است. برخی از اسیدهای آمینه ممکن است با چند کدون متفاوت معرفی شوند و به عبارتی دیگر، چندین کدون میتوانند یک آمینو اسید خاص را رمزگذاری کنند. این ویژگی باعث میشود که اشتباهات در ساختار DNA یا RNA تأثیر کمتری بر روی پروتئینهای نهایی داشته باشد، زیرا تغییر در یک نوکلئوتید ممکن است تنها کدون را به یک کدون دیگر برای همان اسید آمینه تغییر دهد و اثر منفی بر روی پروتئین نگذارد.
اجزای سازندهی ژن
هر ژن از چندین بخش اساسی تشکیل شده است که هر یک نقش خاصی در فرآیند بیان ژن دارند:
- ناحیه پروموتر: این بخش به عنوان یک سوئیچ عمل میکند و تعیین میکند که ژن چه زمانی و در کجا روشن یا خاموش شود. پروموتر نقش کلیدی در تنظیم بیان ژن ایفا میکند و تأثیر زیادی بر تولید پروتئینها دارد.
- ناحیه کدگذاری یا اگزون: این بخش، شامل دستورالعملهای ضروری برای ساخت پروتئینها است. توالیهای نوکلئوتیدی در این ناحیه در طول فرآیند بیان ژن به RNA پیامرسان (mRNA) منتقل میشوند.
- اینترونها: این نواحی غیرکدکننده درون ناحیه کدگذاری یک ژن قرار دارند. طی فرآیند RNA splicing، اینترونها از مولکول mRNA حذف میشوند و فقط توالیهای کدکننده باقی میمانند که به پروتئینها تبدیل میشوند. اینترونها در موجودات یوکاریوتی نسبت به پروکاریوتها شایعتر هستند.
- ناحیه ترمیناتور: این بخش نشاندهنده پایان ژن است و به کنترل خاتمه رونویسی کمک میکند. این ناحیه تعیین میکند که فرآیند رونویسی چه زمانی به پایان برسد.

بیان ژن
بیان ژن فرآیند پیچیدهای است که در آن اطلاعات کدگذاری شده در یک ژن برای سنتز محصولات عملکردی ژن، به ویژه پروتئینها یا مولکولهای RNA غیرکدگذار که عملکردهای مختلفی درون سلول دارند، استفاده میشود. این فرآیند شامل دو مرحله اصلی است: رونویسی و ترجمه.
فرایند بیان ژن بهدقت تنظیم میشود تا کنترل کند که چه زمانی، کجا و به چه میزان از این محصولات تولید شود. به این ترتیب، به موجودات زنده این امکان را میدهد که به تغییرات محیطی سازگار شوند و هموستاز را حفظ کنند. در ادامه به بررسی رونویسی ژن و ترجمه میپردازیم.
رونویسی ژن
رونویسی (Gene transcription)، اولین مرحله در بیان ژن به شمار میآید که در آن اطلاعات کدگذاری شده در DNA به RNA پیامرسان (mRNA) رونویسی میشود. این فرایند هنگامی آغاز میشود که بخشی از مارپیچ DNA از هم باز میشود و یک رشته به عنوان الگوی سنتز RNA عمل میکند. رشته RNA تشکیل شده حاوی یوراسیل (U) به جای تیمین (T) است که آن را از DNA متمایز میکند. mRNA تازه تشکیل شده سپس از DNA جدا شده و از هسته خارج میشود تا در سنتز پروتئین در سیتوپلاسم مشارکت کند. سیتوپلاسم جایی است که mRNA با ریبوزومها، ماشینهای سلولی برای سنتز پروتئین، ترکیب میشود.

ترجمه
پس از رونویسی، ترجمه انجام میشود که در آن کد mRNA به یک توالی خاص از آمینواسیدها ترجمه میشود و پروتئینی را تشکیل میدهد. ریبوزوم وظیفهی خوانش mRNA را برعهده دارد. RNA انتقالی (tRNA) آمینواسیدهای منفرد را حمل میکند. tRNA اسیدهای آمینه را به ترتیبی که توسط توالی mRNA مشخص شده، در کنار هم مونتاژ میکند. هر مولکول tRNA مربوط به یک اسید آمینه خاص است و اطمینان میدهد که پروتئینها به درستی سنتز میشوند. در حالی که اسیدهای آمینه با یکدیگر پیوند میخورند، آنها به کمک مولکولهای چپرون، به یک ساختار سهبعدی پیچیده، تا شده یا فولد میشوند که در نهایت عملکرد پروتئین را تعیین میکند.

تنظیم بیان ژن
تنظیم بیان ژن برای سازگاری و عملکرد سلولی ضروری است. این تنظیم بهعنوان یک سوئیچ (روشن/خاموش) عمل میکند. در واقع فرایند تنظیم بیان ژن کنترل میکند چه زمانی و کجا ژنهای خاصی بیان شوند و همچنین بهعنوان یک (کنترل کننده حجم) مقدار محصولات ژنی تولید شده را تعیین میکند. عوامل مختلفی، از جمله سیگنالهای محیطی و شرایط سلولی، بر این مکانیسم تنظیم اثرگذار هستند و به سلولها اجازه میدهد به طور پویا به تغییرات محیط پاسخ دهند. تعامل بین محصولات RNA و پروتئینهای ژنها نیز به تنظیم بیان ژن کمک کرده و شبکهای پیچیده از تعاملات را ایجاد میکند که مدیریت رفتار سلولی را برعهده دارد.
جهش ژن
جهشها تغییرات دائمی در توالی نوکلئوتیدهای DNA یک موجود زنده هستند. جهشها گاهی ممکن است تاثیر قابل توجهی بر عملکرد ژن داشته باشند. این تغییرات میتوانند به اشکال مختلفی رخ دهند و تأثیرات متنوعی بر فنوتیپ موجود زنده بگذارند که ممکن است قابل تشخیص باشد یا نباشد. جهشها نقشهای حیاتی در فرآیندهای زیستی از جمله تکامل، توسعه سرطان و عملکرد سیستم ایمنی ایفا میکنند و به تنوع ژنتیکی که براساس آن انتخاب طبیعی میتواند عمل کند، کمک میکنند. تنوع بیان ژن و جهش زیربنای ژنتیک مدرن و زیست شناسی مولکولی را تشکیل میدهد و دانشمندان همچنان در حال مطالعه و تحقیقات در این زمینهی گسترده هستند.
انواع جهشها
جهشها میتوانند بر اساس تأثیراتشان بر عملکرد پروتئین و نوع تغییر در توالی DNA به چندین دسته تقسیم شوند. در ادامه به بررسی برخی از جهشها میپردازیم:
جهشهای نقطهای
جهشهای نقطهای شامل جایگزینی یک نوکلئوتید واحد هستند و میتوانند به دستههای زیر تقسیم شوند:
- جهشهای بدمعنی (Missense mutations): این جهشها باعث جایگزینی یک اسید آمینه با اسید آمینهی دیگر در پروتئین میشوند که میتواند منجر به تولید پروتئینهای غیرعملکردی شود، مانند جهشی که در بیماری سلول داسی و ایدروپولیسیس بولوسا اتفاق میافتد.
- جهشهای بیمعنی (Nonsense mutations): این جهشها یک کدون توقف زودهنگام در mRNA رونویسی شده ایجاد میکنند که ممکن است منجر به ایجاد پروتئینهای کوتاه و غالباً غیرعملکردی شود. جهشهای بیمعنی در بیماریهایی مانند هایپرپلازی مادرزادی فوق کلیوی مشاهده میشوند.
- جهش خاموش (Silent mutations): این جهشها موجب تغییر یک کدون و تبدیل آن به یک کدون دیگر برای همان اسید آمینه میشود. به این ترتیب، تغییری در پروتئین ایجاد نمیکند.

جهشهای تغییر چارچوب
جهشهای تغییر چارچوب (Frameshift mutations) توسط اضافه شدن یا حذف نوکلئوتیدهایی که قابل تقسیم به سه نیستند، ایجاد میشوند و به این ترتیب فریم خواندن ژن را مختل میکنند. این جهشها معمولاً منجر به ترجمه کاملاً متفاوتی از پروتئین میشود و به طور قابل توجهی عملکرد آن را تغییر میدهد. برای مثال، اگر یک نوکلئوتید در اوایل یک توالی حذف شود، پروتئین حاصل ممکن است به طور چشمگیری با پروتئین اولیه متفاوت باشد و منجر به عواقب عملکردی مختلفی شود.
جهشهای درون چارچوب
برعکس جهشهای تغییر چارچوب، درج یا حذفهایی که قابل تقسیم به سه هستند، به عنوان جهشهای درون چارچوب (In-Frame Mutations) شناخته میشوند که معمولاً قالب خواندن را مختل نمیکنند و ممکن است تأثیرات کمتری بر پروتئین حاصل داشته باشند.
جهش وارونگی
جهش وارونگی (Inversion mutations)، به معنای آن است که یک بخش از کروموزوم به صورت معکوس و با جهتی دیگر قرار میگیرد. در این حالت، بخش معکوس شده ممکن است بر عملکرد ژنهای آن ناحیه تأثیر بگذارد.

انواع جهش وارونگی شامل:
1. وارونگی پریسنتریک(Pericentric Inversion): در این نوع جهش، ناحیه معکوس شده شامل سنترومر (مرکز کروموزوم) است.
2. وارونگی پاراسنتریک (Paracentric Inversion):در این نوع جهش، ناحیه معکوس شامل سنترومر نیست.
جهش حذف
در جهش حذفی (Deletion Mutation) بخشی از کروموزوم از بین میرود یا حذف میشود که منجر به حذف مواد ژنتیکی ضروری میشود. با توجه به اندازه حذف و ژنهای تحت تأثیر، این جهش میتواند عواقب شدید رشدی یا عملکردی ایجاد کند.
جهش مضاعف شدگی
در این جهش که به آن دوبلیکشن نیز میگویند، بخشی از توالی DNA کپی شده و منجر به کپیهای اضافی از یک ژن یا بخش خاصی از کروموزوم میشود. جهش مضاعف شدگی، میتواند حجم محصولات ژنی را افزایش دهد و اگر بیان ژن افزایش یابد، عملکرد طبیعی سلولی را مختل کند و به طور بالقوه منجر به بیماری میشود.

دلیل ایجاد جهشهای ژن
جهشها با مکانیسمهای مختلفی ایجاد میشوند، از جمله:
- جهشهای خودبخودی: این جهشها بهدلیل خطاهای طبیعی در تکثیر DNA رخ میدهند.
- جهشهای القا شده: این جهشها ناشی از قرار گرفتن در معرض عوامل محیطی یا موتاژنها، مانند مواد شیمیایی یا تابش هستند.
- فرآیندهای ترمیم DNA مستعد خطا: این فرآیندها میتوانند در حین ترمیم DNA آسیبدیده موجب بروز خطاهایی شود که جهشهایی را در ژن ایجاد میکنند.
پیامدهای جهش ژن
جهشها میتوانند مفید، بیاثر یا مضر باشند. جهشهای مفید ممکن است موفقیت تولید مثل را افزایش دهند و به سازگاریهای تکاملی کمک کنند، در حالی که جهشهای مضر میتوانند منجر به اختلالات ژنتیکی یا بیماریها شوند. با این حال، بسیاری از جهشها بیاثر هستند و تأثیر قابل توجهی بر موجود زنده ندارند.
ژن درمانی
ژن درمانی یک تکنیک انقلابی است که با هدف درمان یا پیشگیری از اختلالات ژنتیکی از طریق دستکاری مستقیم ژنها درون سلولهای فردی انجام میشود. این روش معمولاً شامل معرفی، حذف یا تغییر مواد ژنتیکی درون سلولهای بیمار برای مقابله یا کاهش بیماری است.
انواع مکانیسمهای ژن درمانی
متخصصان ژن درمانی میتوانند از روشهای مختلفی برای دستیابی به اهداف خود استفاده کند، از جملهی این مکانیسمها میتوان به موارد زیر اشاره کرد:
اضافه کردن ژن
در اضافه کردن ژن، یک نسخه عملکردی از یک ژن به سلولهای بیمار معرفی میشود تا نقص یا عدم وجود یک ژن غیرعملکردی را جبران کند. این روش به خصوص برای بیماریهایی که به دلیل نقص در یک ژن ایجاد میشوند، مانند فیبروز کیستیک یا انواع خاصی از دیستروفیهای عضلانی سودمند است.

ویرایش ژن
پیشرفتهای اخیر امکان تغییرات دقیق در ژنوم را با استفاده از تکنیکهایی مانند CRISPR-Cas9 فراهم کرده است. این رویکرد اجازه میدهد تا تغییرات هدفمندی در ژنها ایجاد شود تا جهشهای موجود در مکانهای خاص اصلاح شوند و به این ترتیب عملکرد طبیعی ژنها را بازگرداند. ویرایش ژن همچنین میتواند برای خاموش کردن ژنهای معیوب که باعث بیماری میشوند، به کار رود.
کاربردهای بالینی
ژن درمانی برای اختلالات ژنتیکی مختلفی مورد بررسی قرار گرفته است، این اختلالات عبارتند از:
- بیماریهای وراثتی چشمی: ژن درمانی در درمان بیماریهایی مانند لبر آموروزیس مادرزادی (Leber congenital amaurosis) امیدبخش بوده است و ممکن است منجر به بهبود بینایی در برخی بیماران شود.
- هموفیلی: با معرفی ژنهای عملکردی مسئول عوامل انعقاد، بیماران تجربیات قابل توجهی در بهبود وضعیت خود داشتهاند.
- درمان سرطان: ژن درمانی میتواند برای اصلاح سلولهای ایمنی به منظور بهتر هدف قرار دادن و از بین بردن سلولهای سرطانی به کار رود. یکی از مثالهای این کاربرد ژن درمانی، درمان سلول CAR-T است.
چالشهای ژن درمانی
در حالی که ژن درمانی روشی بسیار امیدبخش در مسیر درمان بسیاری از مشکلات ژنتیکی است، اما چندین چالش در روند ژن درمانی همچنان باقی مانده است. این چالشها شامل اطمینان از ایمنی و کارایی روشهای تحویل ژن، پاسخهای ایمنی بالقوه به مواد معرفی شده و پیامدهای اخلاقی ویرایش ژن است. علاوه بر این، هزینههای توسعه و تجویز ژن درمانی میتواند قابل توجه باشد و دسترسی به آنها را به نگرانی جدی تبدیل کند.
جمع بندی
در مجموع، مفهوم ژن یک مفهوم پویا و پیچیده است که با پیشرفت دانش ژنتیک و زیستشناسی مولکولی، دچار تحولات اساسی شده است. از مدل ساده یک ژن-یک آنزیم تا درک امروزی از پیچیدگیهای عملکردی و تنظیمی ژنها، این مسیر نشاندهنده پیشرفت شگرف علم در فهم نحوه توارث ژنتیکی و مکانیسمهای پیچیده حیات است. شناخت ژنها نه تنها به درک بهتر وراثت کمک میکند، بلکه دریچهای به فهم عمیقتر از پیچیدگیهای زیستی و تکاملی موجودات زنده میگشاید.
منابع: medlineplus، britannica، yourgenome